根据协会章程的规定：会员大会是最高权力机构；依章程和选举制度产生理事会、监事、会长、副会长；秘书长按聘任制聘任非会员个人担任。各职能部门及职责设置如下：

1、秘书处职责：财务管理、办公室职能、机要工作、协调各部门工作、机构会员登记管理，从业人员注册登记，注册证管理；
2、伦理委员会：执业纠纷协调、纪律处分、职业伦理教育、执业指导性规范设计、行业标准制定参与；
3、继续教育部：继续教育计划与实施，有偿培训，继续教育管理；
4、社会责任部：社会联络、对外合作、项目策划，行业发展促进；管理心协讲师团。
5、研究發展部：会刊编辑发行、官方网站管理、学术交流、心理文化论坛组织等；
6、危机干预中心：“心理危机干预专员”管理、调度，危机干预热线管理。
7、各专业委员会：致力于各专业领域研究发展促进，行业标准制定参与，执业指导性规范制定参与。专业委员会须按民管局规定条件（15个会员单位参与）成立并向民管局报备；除“技能专业委员会”、“文化专业委员会”等大类可成立专业委员会外；还可细化成立专门小组；